蛋白質組學：蛋白質組一詞，源于蛋白質與基因組兩個詞的組合，意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”，即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組學本質上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲...

轉錄組學的概念：轉錄組是指特定組織或細胞在某一發(fā)育階段或功能狀態(tài)下轉錄出來的所有RNA的匯合，包括蛋白質編碼的信使RNA和非編碼RNA（rRNA、tRNA和其他ncRNAs），高通量測序技術也被稱為下一代測序（NGS）技術，推進了基因組學的研究進展。該項新技術...

蛋白質修飾位點分析：基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質或多肽分子質量這一特性，從而檢測蛋白質或者多肽上位點發(fā)生何種修飾?？蓹z測修飾類型如下： 磷酸化、糖基化、乙?；?、泛素化、丙?；?、丁?；?、丙二?；?、戊二?；?、琥珀酰化、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1...

代謝組學樣本收集植物組織：果實、種子：1）對于含水量高、體積較大的果實（番茄、西瓜、蘋果等）需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中，標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）對于細小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種...

全長轉錄組學測序：由于在轉錄組研究中通常所使用的第二代測序技術具有測序讀長的限制，因此在進行測序之前，需要先將樣本的mRNA打碎為小片段，之后再通過與參考基因組比對或拼接的方式識別轉錄本，這就會造成一定的錯誤比例，同時在也很難區(qū)分單堿基水平的差異。全長轉錄組測...

蛋白組學研究怎么做？PRM:平行反應監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質譜的離子監(jiān)視技術，能夠對目標蛋白質、目標肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，從而實現對目標蛋白質/肽段進行一定定量，因此也被稱之...

轉錄組學技術路線及研究意義：轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更準確的數字化信號...

蛋白質組學研究這樣做：蛋白質組與基因組相對應，也是一個整體的概念，隨著基因組學研究的不斷深入，蛋白質組學已逐漸成為研究熱點，對蛋白組學的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質，但探究成千上萬的蛋白質特性也是一個重大的技術挑戰(zhàn)。蛋白質組（Proteome）指的是...

質譜分析蛋白翻譯后修飾：相對于蛋白質印跡等技術，質譜技術能更有效的對蛋白質的翻譯后修飾進行分析，且可以對常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進行補充。質譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質譜方法無法保證可以完全識...

蛋白質組學發(fā)展趨勢：1、基礎研究方面：近兩年來蛋白質組研究技術已被應用到各種生命科學領域，如細胞生物學、神經生物學等。在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍，涉及到各種重要的生物學現象，如信號轉導、細胞分化、蛋白質折疊等等。在未來的發(fā)展中...

代謝組學研究方法：代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯(lián)用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。...

轉錄組學，基因組學，蛋白質組學的區(qū)別：蛋白組學針對的是全體蛋白，組要以2D-Gel和質譜為主，分為top-down和bottom-up分析方法。理念和基因組類似，將蛋白用特定的物料化學手段分解成小肽段，在通過質量反推蛋白序列，之后進行搜索，標識已知未知的蛋白序...

RNA-seq轉錄組學：也被稱為整個轉錄組鳥測序（wts）。RNA-seq包含三個步驟：測序文庫的建立，在特定平臺中測序和生物信息學分析。RNA-Seq是一種基于NGS技術的新的轉錄分析方法。采用NGS技術對從感興趣的RNA樣本序列反轉錄得到的cDNA進行測序...

代謝組學樣品收集方法及所需樣本量是什么？(1) 血清樣品： 避免反復凍融。血液收集在離心管中靜置30分鐘進行凝血。8000rpm離心10分鐘，取上清分裝到凍存管中，放置液氮中或-80度凍存；單個樣本要求體積為50μL。(2) 尿液樣品：臨床樣本請全部取清晨第1...

蛋白組學研究怎么做？PRM:平行反應監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質譜的離子監(jiān)視技術，能夠對目標蛋白質、目標肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，從而實現對目標蛋白質/肽段進行一定定量，因此也被稱之...

蛋白磷酸化修飾過程：蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化，將磷酸基團從ATP轉移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸，或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過程是可逆的，去磷酸化反應由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測方法：Western Blot檢測方法：Western...

蛋白質組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質基礎，也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質分子”，它們可成為新藥物設計的分子靶點，或者也會為疾病的早期診斷提供分子標...

代謝組學的研究領域有哪些？1、疾病機制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細胞代謝組學研究。7、微生物代謝組學研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少？不同檢測平臺的靈敏度不一樣，靈敏度比較高，可達...

蛋白質組學：對人類而言，蛋白質組學的研究終究要服務于人類的健康，主要指促進分子醫(yī)學的發(fā)展。如尋找藥物的靶分子。很多藥物本身就是蛋白質，而很多藥物的靶分子也是蛋白質。藥物也可以干預蛋白質-蛋白質相互作用。在基礎醫(yī)學和疾病機理研究中，了解人不同發(fā)育、生長期和不同生...

蛋白質糖基化修飾組學技術：糖基化是在酶的控制下,蛋白質或脂質附加上糖類的過程,發(fā)生于內質網和高爾基體等部位。在糖基轉移酶作用下將糖轉移至蛋白質,和蛋白質上的氨基酸殘基共價結合。蛋白質經過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調節(jié)蛋白質功能作...

翻譯后修飾蛋白組學分析：蛋白質組學的研究的工作不只聚焦于細胞不同生長時期或是疾病條件下的蛋白質表達水平變化，許多至關重要的生命進程不只由蛋白質相對豐度控制，更重要的是被時空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調控，因而揭示翻譯后修飾發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質復雜多樣的生物...

選擇代謝組學作為科研技術手段的優(yōu)勢有哪些？代謝組學的研究處于生物信息流的中游，介于基因、蛋白質和細胞、組織之間，在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產生和代謝是基因表達的下游產物，生物體液的代謝產物分析能夠更直接，更準確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代...

代謝組學的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標分子。傳統(tǒng)代謝組學研究利用的是GC-MS，因為代謝物大多數都不是高沸點的，而且GC-MS有龐大的數據庫檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多，就是克服了一些高沸點物質難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學不是很多，一...

質譜分析乙酰化蛋白質組：質譜分析技術可以對蛋白質組中的乙?；鞍走M行鑒定、乙?；稽c定位以及定量。當質譜用于乙?；康鞍捉M研究中時，因為乙?；鞍踪|在生物樣本中含量低、動態(tài)范圍廣，需要先對乙?；亩芜M行富集，然后再對富集得到的乙?；亩螛悠愤M行定量分析。質譜...

代謝組學概念：代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物（MW

轉錄組學(transcriptomics)是功能基因組學(FunctionalGenomics)研究的重要組成部分，是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉錄及轉錄調控規(guī)律的學科。隨著人類基因組計劃HGP(HumanGenomeProject)的完成，科學家也逐...

蛋白質翻譯后修飾組學：蛋白質翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團，可以改變蛋白質的物理、化學性質，進而影響蛋白質的空間構象和活性狀...

單細胞轉錄組關鍵步驟：單細胞的分離和捕獲：溫和分離，稀有細胞。轉錄本的捕獲和擴增：RNA測序需要0.1-1.0ugtotalRNA，捕獲效率10%（5-**NA測序需要1ngDNA，極限稀釋加移液分離單細胞；顯微操作分選單細胞；流式分選帶有表面Mark...

蛋白組學樣本要求：常規(guī)組織：（心、肝、脾、肺、腎、腸、腦、肌肉等）PBS洗滌去除殘留血液和污染物，剔除無關的干擾組織（血管、脂肪、結締組織等）；沖洗干凈，用組織剪或手術刀將組織分離成1cm3左右的小塊；液氮速凍5min，保存于-80℃。軟骨組織：PBS洗滌去除...

蛋白質組學發(fā)展趨勢：技術發(fā)展方面：蛋白質組學的研究方法將出現多種技術并存，各有優(yōu)勢和的特點，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外，更強調各種方法間的整合和互補，以適應不同蛋白質的不同特征。另外，蛋白質組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要...