但是由于CHIP-seq實驗本身的難度較高，DISCOVER-seq這類方法的接受度并不高。3. 其他特殊方法CRISPR技術(shù)經(jīng)過這么多年的發(fā)展，其應(yīng)用已經(jīng)不局限于造成DNA雙鏈斷裂，一些不要切割DNA雙鏈的CRISPR衍生技術(shù)（如堿基編輯、先導(dǎo)編輯和CRISPRi/a），可以在不引發(fā)隨機突變的情況下，對基因組進行精細編輯或者調(diào)控。這些技術(shù)所使用nCas9或dCas9只結(jié)合或者切割雙鏈中的一條鏈，之前的脫靶檢測方法都不能直接適用。這些CRISPR衍生技術(shù)中，CRISPR產(chǎn)生的脫靶可以被細分為兩個部分，其一是Cas9/sgRNA結(jié)合DNA導(dǎo)致的脫靶，這部分信息使用同樣序列的sgRNA進行野生型C...

目前鼓潤已掌握了該項技術(shù)，簡述如下：1、CRISPR與dsODNtag整合的實驗技術(shù)及高通量測序建庫流程將靶向于目標基因組位點的CRISPR質(zhì)粒與dsODNtag以核電轉(zhuǎn)的方式同時轉(zhuǎn)染入真核細胞，CRISPR造成基因組雙鏈斷裂后，dsODNtag將整合入斷點處，作為后續(xù)分析在靶與脫靶情況的標記。轉(zhuǎn)染后3天收集細胞的DNA進行高通量建庫。2、GUIDE-seq生信分析方法1）搭建了高通量測序的數(shù)據(jù)分析流程。2）利用該技術(shù)分析了CRISPR靶向編輯某細胞系基因的在靶與脫靶情況。其中一例樣品的分析結(jié)果如圖4所示：Sequencesofoff-targetsitesidentifiedbyGUIDE-...

長期隨訪的觀察時間長期隨訪的持續(xù)時間應(yīng)確保足以觀察到受試者因產(chǎn)品特性、暴露情況（生物分布和給藥途徑）等導(dǎo)致的風險，應(yīng)不短于遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期發(fā)生時間。一般而言，針對不同類型的基因zhiliao產(chǎn)品建議如下：?具有基因組整合活性的載體（例如γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病毒載體）和轉(zhuǎn)座子元件建議觀察不短于15年。?可以產(chǎn)生持續(xù)ganran、或有潛伏再jihuo風險的細菌或病毒載體（如單純皰疹病毒）建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風險（ganran或再jihuo）?；蚓庉嫯a(chǎn)品建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風險。?腺相關(guān)病毒載體建議觀察5年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風險。脫靶檢測評估標準，推薦唯...

通常不需要進行標準的遺傳毒性組合試驗，但應(yīng)根據(jù)基因zhiliao產(chǎn)品的特點、產(chǎn)品的具體適應(yīng)癥、載體的已有信息、導(dǎo)入基因序列結(jié)構(gòu)等，評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進基因組的可能性，判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究，如研究基因組修飾的發(fā)生情況，并檢測隨后可能發(fā)生的異常細胞行為；評估插入突變（插入位點、插入拷貝數(shù)等）引起的遺傳毒性風險。當基因zhiliao產(chǎn)品采用基因編輯或轉(zhuǎn)座子技術(shù)時，需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題；鑒定/表征基因組整合位點。脫靶檢測安全性評價，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準確率高。off-target脫靶檢測報告持續(xù)ganran，有復(fù)...

gRNA的長度和錯配： 17個核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下，18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細胞中減少潛在脫靶效應(yīng)的指導(dǎo)方針：1) 應(yīng)避免在PAM的7-10 bp范圍內(nèi)靶序列有超過3個錯配；2) 在PAM的12 bp內(nèi)，應(yīng)避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應(yīng)。gRNA的化學修飾：在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦?；宜狨?dǎo)致位點特異性修飾，使脫靶切割減少40-120倍，同時保持靶向性能。gRNA上游5'發(fā)夾結(jié)構(gòu)的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性，降低脫靶效應(yīng)?；蚓庉嫾夹g(shù)脫靶檢測，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高...

近幾年，細胞和基因zhiliao（cell & gene therapy，CGT）領(lǐng)域發(fā)展迅猛，在多個方向取得了重大突破，以anti-CD19和BCMA為代的多種CAR-T免疫細胞療法攻克了一部分血液瘤，多種AAV療法也給一些難以成藥的罕見病提供了有效的zhiliao方案。另一方面，基于CRISPR基因編輯技術(shù)的眾多基因療法也進展迅速，較早體外基因編輯療法較快今年年底能夠上市（CRISPR Therapeutics CTX001），體內(nèi)基因編輯療法取得了不錯的臨床數(shù)據(jù)（Intellia Therapeutics NTLA-2001），使用CRISPR技術(shù)制造的通用型CAR-T療法也是免疫細胞療...

以上長期隨訪時間的建議主要基于基因zhiliao的產(chǎn)品類型，具體產(chǎn)品的隨訪時間取決于產(chǎn)品的特性和體內(nèi)存在時間、轉(zhuǎn)基因表達時間、遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期時間及發(fā)生率、受試者適應(yīng)癥和預(yù)期生存期、給藥途徑、以及長期隨訪的其他觀察目的。隨著隨訪數(shù)據(jù)的積累，研究者和研究申辦方可能會根據(jù)產(chǎn)品的存在情況、轉(zhuǎn)基因表達和臨床表現(xiàn)的持續(xù)評估情況，延長或縮短長期隨訪的持續(xù)時間。如果研究申辦方認為其基因zhiliao產(chǎn)品安全性風險較低、無需開展長期隨訪臨床研究，或者希望變更隨訪時間，應(yīng)合理說明依據(jù)或變更理由并與藥品監(jiān)督管理部門進行溝通。預(yù)算允許的情況下，通過全基因組測序的方法進行全基因組序列的分析和比對更精細，如基于NG...

CRISPR/Cas9的問題：和TALEN和ZFNS技術(shù)一樣，CRISPR/Cas9技術(shù)在應(yīng)用時也存在一定概率的脫靶問題——Cas9核酸酶在非目標位點發(fā)生切割，引入非預(yù)期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會直接破壞細胞的基本功能，帶來不可預(yù)控的嚴重后果。如何減輕脫靶效應(yīng)？gRNA的GC含量：gRNA 的序列結(jié)構(gòu)對CRISPR/Cas9基因編輯的靶向活性有影響。gRNA 序列中 40%–60%的 GC 含量可以增加靶向活性，因為較高的 GC 含量穩(wěn)定了DNA：RNA 雙鏈體并破壞了脫靶結(jié)合。gRNA-on-gRNA序列的位置對編輯有影響，位于四個核苷酸末端的嘌呤殘基可以提高編輯效率。鳥嘌呤優(yōu)先選...

臨床研究人群，如果一種基因zhiliao產(chǎn)品具有引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風險，需要開展長期隨訪觀察時，所有接受基因zhiliao產(chǎn)品的受試者在簽署知情同意書后均應(yīng)入組長期隨訪臨床研究。在設(shè)計長期隨訪臨床研究的方案時，應(yīng)考慮目標受試者人群及特征、整體健康情況以及接受zhiliao的患者的預(yù)期生存期等特征對遲發(fā)性不良反應(yīng)的收集的影響。通常來說，當臨床研究人群的某些特征（如預(yù)期壽命短、多重合并癥、以及暴露于放療或化療等其他藥物）可能干擾遲發(fā)性不良反應(yīng)的觀察分析時，會影響長期隨訪觀察在評估和減輕受試者風險方面的效用；而在病情較輕或較局限，合并癥以及伴隨zhiliao有限或較穩(wěn)定的受試者中，通過長期隨訪觀察...

CRISPR基因編輯zhiliao發(fā)展如火如荼，但也有不少人對基因zhiliao的安全性提出擔憂，由于CRISPR技術(shù)是直接改變基因組DNA，其中任何的改變都會被長久保留下來，所以CRISPR對于DNA序列的任何改變都需要嚴謹?shù)陌踩u估。根據(jù)目前已經(jīng)公開的FDA關(guān)于基因zhiliao的指導(dǎo)文件，對于基因zhiliao安全性的評估可以簡單總結(jié)為兩個方面：由于目前大部分CRISPR基因編輯zhiliao方案是基于CRISPR引起的DNA雙鏈斷裂和隨機突變進行基因敲除，所以一類風險主要是指靶位點的隨機突變引發(fā)的安全風險，如果出現(xiàn)大片段丟失、染色體重排等異常變化，都存在巨大的安全隱患。脫靶檢測方法，推...

如果基因zhiliao產(chǎn)品通過全身給xingfang式遞送，長期隨訪中的安全性監(jiān)測不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性，而且還應(yīng)包括可能發(fā)生在其他組織和qiguan中的脫靶活性。基因組整合性或者脫靶活性的分析通常需采用有創(chuàng)性12檢測方法取得樣本，實施時還需要考慮技術(shù)和倫理上的可行性，例如靶向視網(wǎng)膜或肝臟等組織的基因zhiliao產(chǎn)品，可能難以對靶細胞采樣，這種情況下可能需要通過密切的臨床隨訪等方式間接評估風險；同時，選擇易于采樣的替代細胞也可能提供關(guān)于相關(guān)信息，例如靶向骨髓造血干細胞的基因zhiliao產(chǎn)品，可以通過采集外周血細胞或富集外周血干細胞進行觀察?；蚓庉嬅摪袡z測，推薦唯可生物，...

細胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學特性，同時也會帶來新的安全性風險，如基因編輯脫靶風險、載體插入突變風險、載體重組風險、表達的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風險等。細胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學特性，同時也會帶來新的安全性風險，如基因編輯脫靶風險、載體插入突變風險、載體重組風險、表達的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風險等?；诨蛐揎椉毎漠a(chǎn)品種類繁多、各有特點，除上述一般技術(shù)要求外，還應(yīng)基于產(chǎn)品的性進行相應(yīng)的特殊考慮。本指導(dǎo)原則列舉了以下三種情形的特殊考慮。預(yù)算允許的情況下，通過全基因組測序的方法進行全基因組序列的分析和比對更精細，如基于NGS的iGUIDE方法。連云港種子脫靶檢測方法CRISPR/Cas9的問題：和TALEN和Z...

使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計核酸酶進行基因組編輯，可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點。然而，可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾，這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定，并破壞正?；虻墓δ?，從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題?；蚓庉嬆壳暗拿摪蟹治黾夹g(shù)主要依賴于生物信息學預(yù)測和全基因組脫靶檢測技術(shù)。這些預(yù)測缺乏可靠性，因為它們只涵蓋了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術(shù)檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我...

CRISPR/Cas9的問題：和TALEN和ZFNS技術(shù)一樣，CRISPR/Cas9技術(shù)在應(yīng)用時也存在一定概率的脫靶問題——Cas9核酸酶在非目標位點發(fā)生切割，引入非預(yù)期的基因突變。脫靶切割引入的突變可能會直接破壞細胞的基本功能，帶來不可預(yù)控的嚴重后果。如何減輕脫靶效應(yīng)？gRNA的GC含量：gRNA 的序列結(jié)構(gòu)對CRISPR/Cas9基因編輯的靶向活性有影響。gRNA 序列中 40%–60%的 GC 含量可以增加靶向活性，因為較高的 GC 含量穩(wěn)定了DNA：RNA 雙鏈體并破壞了脫靶結(jié)合。gRNA-on-gRNA序列的位置對編輯有影響，位于四個核苷酸末端的嘌呤殘基可以提高編輯效率。鳥嘌呤優(yōu)先選...

由于設(shè)計的sgRNA會與非靶點DNA序列錯配，引入非預(yù)期的基因突變，即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性，這無疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此，研究者希望能開發(fā)有效的方法來檢測脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評估方法中，有一種方法為GUIDE-seq，其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸（dsODN）標記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂，然后對標簽所在的基因組區(qū)域進行高通量測序，通過生物信息學分析從而確定脫靶位點。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測CRISPR脫靶效應(yīng)，從而改變了以往先預(yù)測假定脫靶位點再檢測的思路；與其他的評估方法相比，GUIDE-seq更...

gRNA的長度和錯配： 17個核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下，18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細胞中減少潛在脫靶效應(yīng)的指導(dǎo)方針：1) 應(yīng)避免在PAM的7-10 bp范圍內(nèi)靶序列有超過3個錯配；2) 在PAM的12 bp內(nèi)，應(yīng)避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應(yīng)。gRNA的化學修飾：在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦?；宜狨?dǎo)致位點特異性修飾，使脫靶切割減少40-120倍，同時保持靶向性能。gRNA上游5'發(fā)夾結(jié)構(gòu)的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性，降低脫靶效應(yīng)。種子基因脫靶檢測，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢...

細胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學特性，同時也會帶來新的安全性風險，如基因編輯脫靶風險、載體插入突變風險、載體重組風險、表達的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風險等。細胞經(jīng)基因修飾后會改變其生物學特性，同時也會帶來新的安全性風險，如基因編輯脫靶風險、載體插入突變風險、載體重組風險、表達的轉(zhuǎn)基因產(chǎn)物的風險等?；诨蛐揎椉毎漠a(chǎn)品種類繁多、各有特點，除上述一般技術(shù)要求外，還應(yīng)基于產(chǎn)品的性進行相應(yīng)的特殊考慮。本指導(dǎo)原則列舉了以下三種情形的特殊考慮?？梢耘c靶基因之外的其他基因作用而非特異性阻斷基因表達,即產(chǎn)生非靶基因的沉默效應(yīng)。常州育種脫靶檢測安評堿基編輯器：CBE：胞嘧啶堿基編輯器(Cytosine base edito...

圍繞大家關(guān)心的CRISPR基因編輯安全性問題，我們首先對CRISPR脫靶位點檢測技術(shù)進行一次大盤點，在sgRNA設(shè)計階段需要如何做才能夠盡可能地避免脫靶現(xiàn)象的發(fā)生。較簡單的脫靶位點檢測方法是全基因組測序（WGS），但在實際使用中，即使測序深度達到100X，也很難發(fā)現(xiàn)一些低頻率的脫靶位點，同時測序成本卻非常高。為彌補WGS的這些缺陷，常見的脫靶位點檢測技術(shù)都需要對脫靶位點進行捕獲富集，來提高檢測靈敏度，降低測序成本。按照實驗原理的不同，脫靶位點檢測技術(shù)可以分為細胞外、細胞內(nèi)和其他特殊方法這3類。脫靶檢測安全性評價，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準確率高。深圳脫靶檢測企業(yè)細胞...

細胞外檢測方法：細胞外檢測方法較為直接，將基因組提純后進行CRISPR體外切割實驗，再捕獲發(fā)生脫靶切割的位點即可。1) Digenome-seqDigenome-seq是較早提出的一類細胞外脫靶位點檢測方法，提純的基因組DNA被Cas9/sgRNA切割后，再經(jīng)過標準的全基因組測序流程獲得測序數(shù)據(jù)，之后需要較為復(fù)雜的生物信息學分析才能夠獲得CRISPR切割位點的信息?？傮w來講，這種方法測序成本較高，并且檢測靈敏度也有限。2)SITE-seq為了有效檢測到低頻脫靶位點，一般需要在建庫時定向捕獲CRISPR切割位點。SITE-seq就是這樣一種測序方法，提純的基因組DNA經(jīng)過Cas9/sgRNA切割...

細胞外檢測方法：細胞外檢測方法較為直接，將基因組提純后進行CRISPR體外切割實驗，再捕獲發(fā)生脫靶切割的位點即可。1) Digenome-seqDigenome-seq是較早提出的一類細胞外脫靶位點檢測方法，提純的基因組DNA被Cas9/sgRNA切割后，再經(jīng)過標準的全基因組測序流程獲得測序數(shù)據(jù)，之后需要較為復(fù)雜的生物信息學分析才能夠獲得CRISPR切割位點的信息?？傮w來講，這種方法測序成本較高，并且檢測靈敏度也有限。2)SITE-seq為了有效檢測到低頻脫靶位點，一般需要在建庫時定向捕獲CRISPR切割位點。SITE-seq就是這樣一種測序方法，提純的基因組DNA經(jīng)過Cas9/sgRNA切割...

基因編輯產(chǎn)品除了適用基因zhiliao產(chǎn)品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外，長期隨訪中還應(yīng)額外關(guān)注脫靶風險，量化評估脫靶活性和在靶活性之間的相關(guān)性，或利用在靶活性來預(yù)測脫靶活性的水平。在開發(fā)過程中應(yīng)同時關(guān)注基因轉(zhuǎn)導(dǎo)效率、脫靶效率、插入突變情況、目的基因在靶細胞中整合位點及表達。評估基因zhiliao產(chǎn)品整合進基因組的可能性，判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究，評估插入突變（插入位點、插入拷貝數(shù)等）引起的遺傳毒性風險。需要關(guān)注脫靶編輯、轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座印跡引起的遺傳毒性問題；鑒定/表征基因組整合位點。非臨床研究是藥物開發(fā)的重要環(huán)節(jié)之一。脫靶檢測guide-sequence，推薦唯可生物，實驗實力強...

圍繞大家關(guān)心的CRISPR基因編輯安全性問題，我們首先對CRISPR脫靶位點檢測技術(shù)進行一次大盤點，在sgRNA設(shè)計階段需要如何做才能夠盡可能地避免脫靶現(xiàn)象的發(fā)生。較簡單的脫靶位點檢測方法是全基因組測序（WGS），但在實際使用中，即使測序深度達到100X，也很難發(fā)現(xiàn)一些低頻率的脫靶位點，同時測序成本卻非常高。為彌補WGS的這些缺陷，常見的脫靶位點檢測技術(shù)都需要對脫靶位點進行捕獲富集，來提高檢測靈敏度，降低測序成本。按照實驗原理的不同，脫靶位點檢測技術(shù)可以分為細胞外、細胞內(nèi)和其他特殊方法這3類。如何檢測是否發(fā)生脫靶？武漢off-target脫靶檢測CRO細胞外檢測方法：細胞外檢測方法較為直接，將...

GUIDE-Seq脫靶評估技術(shù)的優(yōu)勢分析鼓潤致力于基因組編輯工具脫靶的分析檢測工作，為篩選、優(yōu)化基因組編輯工具的保真性提供標準化的分析。我們脫靶分析具有如下優(yōu)勢：實用性強：能反映CRISPR在真核細胞中進行基因編輯的在靶與脫靶情況，以進行安全性和有效性評價；檢測通量高：一次能檢測多個樣本的在靶與脫靶情況，并通過優(yōu)化的標簽設(shè)計，降低實際的測序reads數(shù)量；準確性高：絕大部分檢測結(jié)果可被驗證；靈敏度高：能夠高效檢測出低頻脫靶位點，檢測低至0.1%的脫靶突變；實驗難度低：操作過程簡單易行細胞適應(yīng)性強。脫靶檢測安評，推薦唯可生物，實驗實力強，專業(yè)性高，檢測效率高，結(jié)果準確率高。深圳脫靶檢測guide...

持續(xù)ganran，有復(fù)制能力的病毒或細菌載體基因zhiliao產(chǎn)品，有可能在免疫能力低下的患者中發(fā)展為持續(xù)ganran，進一步增加發(fā)生遲發(fā)但嚴重ganran的風險?；蚓庉嫽钚?，基因編輯等新型基因zhiliao產(chǎn)品有獨特的基因組修飾功能，可誘導(dǎo)人類基因組中的位點特異性改變或修飾，同時也可能在基因組中發(fā)生脫靶效應(yīng)，導(dǎo)致非預(yù)期的基因表達變化，進而增加未知且不可預(yù)測的遲發(fā)性不良反應(yīng)風險。非預(yù)期的生物分布，某些基因zhiliao產(chǎn)品需要在特定的細胞或組織中表達以實現(xiàn)zhiliao目的，如果基因zhiliao產(chǎn)品在非預(yù)期的細胞、組織或qiguan中表達或修飾，可能引起非靶細胞功能、生長或/分化改變，甚至...

不同基因zhiliao產(chǎn)品的特殊考慮。關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品，例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體，或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細胞，長期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風險，建議申辦方分析基因zhiliao載體在靶細胞或相關(guān)替代細胞的基因組中整合的影響（例如是否存在克隆性生長、是否存在優(yōu)勢克隆、克隆性生長是否導(dǎo)致惡性liu等）。如果基因組整合相關(guān)風險的分析可行，應(yīng)注意以下幾點：?在接受基因zhiliao產(chǎn)品的較初5年內(nèi)，兩次檢測間的采樣間隔建議不超過6個月。此后每年至少檢測一次，直至檢測數(shù)...

使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設(shè)計核酸酶進行基因組編輯，可以將遺傳物質(zhì)定向?qū)氩溉閯游锘蚪M的特定位點。然而，可能會出現(xiàn)非預(yù)期的靶上和靶外基因組修飾，這可能導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定，并破壞正?；虻墓δ?，從而可能導(dǎo)致臨床前和臨床研究中的安全問題?；蚓庉嬆壳暗拿摪蟹治黾夹g(shù)主要依賴于生物信息學預(yù)測和全基因組脫靶檢測技術(shù)。這些預(yù)測缺乏可靠性，因為它們只涵蓋了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術(shù)檢測到。我們是開發(fā)用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅(qū)。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我...

采用基因編輯技術(shù)制備的細胞產(chǎn)品。對于采用基因編輯技術(shù)制備的基因修飾細胞產(chǎn)品，應(yīng)進行體外在靶和脫靶活性評估，以確認修飾酶或向?qū)NA對靶基因序列的特異性。在評估基因編輯的脫靶風險時，應(yīng)說明所選擇的評價策略的合理性和敏感性。雖然采用計算機分析預(yù)測基因編輯的潛在脫靶位點，并對潛在脫靶位點進行深度測序分析，可用于評估基因編輯的脫靶風險；但選擇的評價策略仍應(yīng)包含體外全基因組測序比對，以證明潛在脫靶位點未出現(xiàn)脫靶。此外，在評估脫靶活性時，還應(yīng)評估種屬特異性的差異、細胞病理生理狀態(tài)的差異或細胞類型的差異對非臨床數(shù)據(jù)預(yù)測性的影響。必要時，還應(yīng)分析基因編輯對細胞表型和生理功能的潛在影響。育種脫靶檢測，推薦唯可生...

基因重排或重組。當基因zhiliao產(chǎn)品所用載體及其攜帶的基因發(fā)生復(fù)制時，可能出現(xiàn)非zhiliao目的非預(yù)期的基因表達或改變，或者與相應(yīng)野生型或輔助病毒互補后產(chǎn)生回復(fù)突變或意外復(fù)制或形成6新的病毒。免疫原性。由于基因zhiliao產(chǎn)品在體內(nèi)的持續(xù)暴露或者需要多次給藥等情況，機體可能產(chǎn)生針對基因zhiliao載體或編碼的作用因子的免疫應(yīng)答。由于基因zhiliao產(chǎn)品在靶細胞或組織中的表達時間、分布范圍或表達強度等差異，機體免疫應(yīng)答的后果可能從不具有臨床意義的一過性的免疫反應(yīng)，到針對靶細胞或組織的免疫攻擊，甚至產(chǎn)生嚴重危及生命的不良事件。檢測脫靶效應(yīng)比較好的方法:CIRCLE-seq。臺州基因編輯...

以上長期隨訪時間的建議主要基于基因zhiliao的產(chǎn)品類型，具體產(chǎn)品的隨訪時間取決于產(chǎn)品的特性和體內(nèi)存在時間、轉(zhuǎn)基因表達時間、遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期時間及發(fā)生率、受試者適應(yīng)癥和預(yù)期生存期、給藥途徑、以及長期隨訪的其他觀察目的。隨著隨訪數(shù)據(jù)的積累，研究者和研究申辦方可能會根據(jù)產(chǎn)品的存在情況、轉(zhuǎn)基因表達和臨床表現(xiàn)的持續(xù)評估情況，延長或縮短長期隨訪的持續(xù)時間。如果研究申辦方認為其基因zhiliao產(chǎn)品安全性風險較低、無需開展長期隨訪臨床研究，或者希望變更隨訪時間，應(yīng)合理說明依據(jù)或變更理由并與藥品監(jiān)督管理部門進行溝通。如何檢測是否發(fā)生脫靶? 基因編輯的脫靶率檢測一般有兩種方法。臺州crispr/cas9...

BLESS：利用生物素標簽對DSBs進行原位標記，后經(jīng)PCR擴增實現(xiàn)對于生物素標記片段的富集，并通過二代測序?qū)崿F(xiàn)脫靶位點檢測。直接檢測細胞中的切割位點，靈敏度與細胞、組織密切相關(guān)。LAM-HTGTS，片段化的gDNA經(jīng)過LAM-PCR引入接頭，然后進行全基因組易位測序。高通量的全基因組范圍檢測，可準確檢測DSBs引發(fā)的重排。GUIDE-Seq，將dsODN s標簽整合到DSBs位點，通過二代測序檢測這些標簽所在的基因組區(qū)域，從而確定脫靶突變的位置。廣使用的細胞內(nèi)檢測方法。能檢測低頻脫靶突變。Digenome-Seq，片段化的gDNA與CRISPR/RNP混合孵育，進行全基因組測序檢測脫靶...