由于設(shè)計(jì)的sgRNA會(huì)與非靶點(diǎn)DNA序列錯(cuò)配，引入非預(yù)期的基因突變，即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性，這無(wú)疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此，研究者希望能開發(fā)有效的方法來(lái)檢測(cè)脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評(píng)估方法中，...

拷貝數(shù)，是指某基因（可以是質(zhì)粒）在某一生物的基因組中的個(gè)數(shù)。單拷貝就是該基因在該生物基因組中只有一個(gè)，多拷貝則指有多個(gè)。在細(xì)菌細(xì)胞中，根據(jù)復(fù)制特性，質(zhì)粒分嚴(yán)緊型和松弛型兩類，前者在細(xì)胞中只含1?2個(gè)，而后者含10?15個(gè)以上。恒定的拷貝數(shù)與質(zhì)粒復(fù)制控制系統(tǒng)、宿...

靶細(xì)胞群的轉(zhuǎn)化可能性，這可能與細(xì)胞的分化狀態(tài)、增殖潛力、體外培養(yǎng)條件和體內(nèi)植入環(huán)境等有關(guān)?；谝延锌茖W(xué)經(jīng)驗(yàn)和既往非臨床/臨床研究結(jié)果，如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長(zhǎng)期存續(xù)，需綜合分析以上風(fēng)險(xiǎn)因素，評(píng)估潛在的插入突...

質(zhì)粒載體的分類：按復(fù)制形式：分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少，可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型：嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制，拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制...

插入突變風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估一些整合性載體（如逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒、轉(zhuǎn)座子）可將外源基因插入整合到細(xì)胞基因組中，這可能會(huì)導(dǎo)致關(guān)鍵基因突變或jihuo原基因，從而導(dǎo)致惡性liu風(fēng)險(xiǎn)增加。影響插入突變的關(guān)鍵風(fēng)險(xiǎn)因素包括：（1）載體的整合特征，如插入位點(diǎn)的偏好性；（2）載體的設(shè)計(jì)...

基因的拷貝數(shù)與幾倍體是沒什么關(guān)系的？在不考慮突變的前提下，基因的拷貝數(shù)和幾倍體是直接相關(guān)的，因?yàn)榛虻妮d體是染色體，幾倍體是指染色體的倍數(shù)。打個(gè)比方，人有46條染色體，2二倍體，在人的21號(hào)染色體上有一個(gè)等位基因A，純合子。那么正常人基因A的拷貝數(shù)是2，而21...

CIRCLE-seq和CHANGE-seq與SITE-seq同期發(fā)表的CIRCLE-seq一定程度上解決了SITE-seq的一些問(wèn)題。CIRCLE-seq的第一步是將純化后的基因組DNA隨機(jī)打斷成300bp左右的片段，然后首尾相連成環(huán)狀DNA，這種方法很好地避...

確證性臨床試驗(yàn)。與其它藥物一樣，免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品的確證性研究（或關(guān)鍵研究）的目的是確認(rèn)探索性研究中初步提示的療效和安全性，為注冊(cè)提供關(guān)鍵的獲益/風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估證據(jù)。確證性研究的目標(biāo)人群、主要和次要終點(diǎn)的選擇、研究持續(xù)時(shí)間、樣本量估計(jì)和統(tǒng)計(jì)學(xué)設(shè)計(jì)等應(yīng)符合具體...

使用核酸載體進(jìn)行基因轉(zhuǎn)導(dǎo)或修飾時(shí)，應(yīng)持續(xù)關(guān)注細(xì)胞產(chǎn)品中載體系統(tǒng)的殘留情況，分析外源在基因組中的插入位置、拷貝數(shù)等，監(jiān)控基因編輯用酶的細(xì)胞內(nèi)持續(xù)表達(dá)時(shí)間等，并在受試者給藥后進(jìn)行長(zhǎng)期安全性監(jiān)測(cè)。當(dāng)基因zhiliao產(chǎn)品在生殖qiguan持續(xù)存在時(shí)，需要進(jìn)一步研究確...

關(guān)于整合性載體的特殊考慮如受試者接受整合性載體基因zhiliao產(chǎn)品，例如轉(zhuǎn)座子元件、γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒、慢病毒及其他逆轉(zhuǎn)錄病毒載體，或利用整合性載體或基于轉(zhuǎn)座子的載體在體外修飾的細(xì)胞，長(zhǎng)期隨訪中需格外關(guān)注基因zhiliao產(chǎn)品的基因組整合風(fēng)險(xiǎn)，建議申辦方分析基因...

在沒有接受任何橋接zhiliao的3名患者中，1名患者有PR,2名患者有PD之前接受過(guò)CAR-T細(xì)胞zhiliao。CAR-T細(xì)胞zhiliao后，16例患者發(fā)生CRS，其中3例為高級(jí)別CRS。6例ICANS,2例ICANS等級(jí)高。CAR-T細(xì)胞拷貝的峰值水平...

長(zhǎng)期隨訪獲得的臨床經(jīng)驗(yàn)以及基因組整合位點(diǎn)分析方法的明顯改進(jìn)，都有助于更好地理解整合性基因zhiliao載體相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)。很多能夠介導(dǎo)外源基因轉(zhuǎn)入細(xì)胞核的載體（如逆轉(zhuǎn)錄病毒載體、轉(zhuǎn)座子元件和基因編輯產(chǎn)品等）有基因組整合潛力，需要通過(guò)長(zhǎng)期隨訪觀察遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)；...

病人在6個(gè)月后達(dá)到MRD陰性，CAR-T細(xì)胞在4.2年后仍然可以在外周血檢測(cè)到，并且骨髓中檢測(cè)不到B細(xì)胞liu克隆。二代測(cè)序整合位點(diǎn)分析顯示這是因?yàn)槟承〤AR-T細(xì)胞的融合位置位于TET2基因9號(hào)到10號(hào)外顯子之間可變剪切區(qū)域，導(dǎo)致TET2基因跳讀和功能障礙，...

CAR-T細(xì)胞輸注后患者反應(yīng)及毒性分析：本次收集攻擊113例患者，采用qPCR和dPCR檢測(cè)20例使用axis-cel和tissa-cel處理的gDNA樣本的拷貝數(shù)。在接受tissa-celzhiliao的患者中，9例患者接受了DLBCLzhiliao，1例患...

CRISPR基于sgRNA與基因組序列互補(bǔ)定位到靶位點(diǎn)，不論哪種CRISPR系統(tǒng)，都存在sgRNA序列不完全匹配但能夠結(jié)合基因組的脫靶現(xiàn)象，CRISPR定位到脫靶位點(diǎn)引發(fā)序列改變就屬于第二類風(fēng)險(xiǎn)。CRISPR技術(shù)誕生剛過(guò)10年，期間迅速取代TALEN和ZFN，...

基因編輯產(chǎn)品建議觀察15年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。?腺相關(guān)病毒載體建議觀察5年或至數(shù)據(jù)表明不再存在任何風(fēng)險(xiǎn)。以上長(zhǎng)期隨訪時(shí)間的建議主要基于基因zhiliao的產(chǎn)品類型，具體產(chǎn)品的隨訪時(shí)間取決于產(chǎn)品的特性和體內(nèi)存在時(shí)間、轉(zhuǎn)基因表達(dá)時(shí)間、遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期...

病人在6個(gè)月后達(dá)到MRD陰性，CAR-T細(xì)胞在4.2年后仍然可以在外周血檢測(cè)到，并且骨髓中檢測(cè)不到B細(xì)胞liu克隆。二代測(cè)序整合位點(diǎn)分析顯示這是因?yàn)槟承〤AR-T細(xì)胞的融合位置位于TET2基因9號(hào)到10號(hào)外顯子之間可變剪切區(qū)域，導(dǎo)致TET2基因跳讀和功能障礙，...

長(zhǎng)期隨訪的觀察時(shí)間長(zhǎng)期隨訪的持續(xù)時(shí)間應(yīng)確保足以觀察到受試者因產(chǎn)品特性、暴露情況（生物分布和給藥途徑）等導(dǎo)致的風(fēng)險(xiǎn)，應(yīng)不短于遲發(fā)性不良反應(yīng)的預(yù)期發(fā)生時(shí)間。一般而言，針對(duì)不同類型的基因zhiliao產(chǎn)品建議如下：?具有基因組整合活性的載體（例如γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒和慢病...

當(dāng)產(chǎn)品預(yù)期的活性成分可以明確時(shí)，申請(qǐng)人往往選擇較能代預(yù)期活性的特定細(xì)胞亞群來(lái)描述產(chǎn)品劑量，例如，很多導(dǎo)入外源基因的免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品中的載體陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)。在這種情況下，申請(qǐng)人還應(yīng)描述載體陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)與其它細(xì)胞成分的比例，并分析轉(zhuǎn)導(dǎo)效率對(duì)患者安全性及有效性的...

采用基因編輯技術(shù)制備的細(xì)胞產(chǎn)品。對(duì)于采用基因編輯技術(shù)制備的基因修飾細(xì)胞產(chǎn)品，應(yīng)進(jìn)行體外在靶和脫靶活性評(píng)估，以確認(rèn)修飾酶或向?qū)NA對(duì)靶基因序列的特異性。在評(píng)估基因編輯的脫靶風(fēng)險(xiǎn)時(shí)，應(yīng)說(shuō)明所選擇的評(píng)價(jià)策略的合理性和敏感性。雖然采用計(jì)算機(jī)分析預(yù)測(cè)基因編輯的潛在脫靶...

CAR-T，全稱是ChimericAntigenReceptorT-CellImmunotherapy，指的是嵌合抗原受體T細(xì)胞免疫療法。通過(guò)基因轉(zhuǎn)導(dǎo)方法轉(zhuǎn)染T淋巴細(xì)胞，賦予T細(xì)胞liu靶向性、更強(qiáng)的殺傷活性和持久的殺傷力。從而使其能特異性地識(shí)別和高效殺傷**...

ddPCR與qPCR在監(jiān)測(cè)CART細(xì)胞拷貝數(shù)靈敏度比較，CAR-T細(xì)胞免疫zhiliao發(fā)展迅速，CAR-T細(xì)胞zhiliao后的動(dòng)力學(xué)監(jiān)測(cè)對(duì)患者隨訪至關(guān)重要，對(duì)指導(dǎo)接受CAR - T細(xì)胞zhiliao的患者的臨床決策也很重要。在給藥前，CAR - T細(xì)胞產(chǎn)品...

不論在科研還是臨床中，CRISPR技術(shù)的使用都帶來(lái)了非常高的回報(bào)，也同時(shí)伴隨著各種風(fēng)險(xiǎn)，這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險(xiǎn)。本文中我們盤點(diǎn)了多種主流的CRISPR脫靶位點(diǎn)檢測(cè)方法，但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測(cè)，一個(gè)項(xiàng)目中只使用一...

使用腳本抓取Readsgroup1類型reads，根據(jù)比對(duì)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，計(jì)算染色體斷點(diǎn)位置以及HBV序列的斷裂信息。唯可公司的整合位點(diǎn)分析服務(wù)采用LM-PCR方法，可以有效分析重組細(xì)胞外源序列的整合位點(diǎn)，充分評(píng)估插入突變的可能性和相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)，保證重組細(xì)胞安全性，...

拷貝數(shù)，對(duì)于質(zhì)粒載體，拷貝數(shù)是我們關(guān)心的特性之一。實(shí)際上，每個(gè)細(xì)菌中的質(zhì)粒的拷貝數(shù)主要決定于質(zhì)粒本身的復(fù)制特性。按照復(fù)制性質(zhì)，可以把質(zhì)粒分為兩類：嚴(yán)緊型質(zhì)粒：當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制一次時(shí)，質(zhì)粒也復(fù)制一次，每個(gè)細(xì)菌內(nèi)只含1～2個(gè)質(zhì)粒；松弛型質(zhì)粒：當(dāng)細(xì)菌染色體復(fù)制停止后...

質(zhì)粒載體的分類：按復(fù)制形式：分為嚴(yán)緊型和松弛型復(fù)制。根據(jù)質(zhì)粒DNA復(fù)制與宿主之間的關(guān)系或在宿主細(xì)胞的拷貝數(shù)的多少，可以將質(zhì)粒分為兩種不同的復(fù)制類型：嚴(yán)緊型和松弛型。嚴(yán)緊型質(zhì)粒復(fù)制受宿主染色體DNA復(fù)制的嚴(yán)格控制，拷貝數(shù)較小一般只有1~3個(gè)拷貝。疏松型質(zhì)粒的復(fù)制...

誘導(dǎo)多能干細(xì)胞來(lái)源的細(xì)胞產(chǎn)品。誘導(dǎo)多能干細(xì)胞（inducedpluripotentstemcell，iPS）自身具有致瘤性風(fēng)險(xiǎn)，在體內(nèi)可形成畸胎瘤，整合病毒載體的使用和誘導(dǎo)多能性可能增加iPS細(xì)胞插入致突變性和致性的風(fēng)險(xiǎn)。因此，應(yīng)在shou次臨床試驗(yàn)前完成...

質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移與穿梭質(zhì)粒質(zhì)粒的接合轉(zhuǎn)移：是細(xì)菌遺傳物質(zhì)轉(zhuǎn)移的一個(gè)重要方式。在質(zhì)粒轉(zhuǎn)移過(guò)程中，供體菌和受體菌通過(guò)結(jié)合作用緊密接觸，質(zhì)粒從供體細(xì)胞向受體轉(zhuǎn)移，同時(shí)進(jìn)行質(zhì)粒復(fù)制。按能否自主轉(zhuǎn)移，可以將天然存在的質(zhì)粒分為轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒和非轉(zhuǎn)移型質(zhì)粒兩大類。這里要注意的是，...

上述建議是基于現(xiàn)有科學(xué)認(rèn)識(shí)，隨著臨床研究和應(yīng)用數(shù)據(jù)的積累，以及對(duì)免疫細(xì)胞zhiliao產(chǎn)品了解的深入，可能會(huì)對(duì)隨訪時(shí)間的建議進(jìn)行調(diào)整。根據(jù)臨床試驗(yàn)的研究計(jì)劃和持續(xù)時(shí)間，長(zhǎng)期隨訪可能作為臨床試驗(yàn)的一部分，或者設(shè)計(jì)為一項(xiàng)單獨(dú)研究，如果對(duì)長(zhǎng)期監(jiān)測(cè)有一個(gè)單獨(dú)的研究方案...

CIRCLE-Seq，將gDNA打斷并環(huán)化，環(huán)化的DNA與CRISPR/RNP孵育，NGS測(cè)序檢測(cè)線性化的DNapian段，確定脫靶位點(diǎn)。PCR富集后測(cè)序，成本相對(duì)較低，能檢測(cè)低頻脫靶突變。安必奇sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估，安必奇生物提供sgRNA脫靶效應(yīng)評(píng)估服務(wù)...