與coaccessibilityscore較高的Cicero連接相比，coaccessibilityscore較低的Cicero連接在GeneHancerdoubleelite數(shù)據(jù)庫中的可能性較小(p<2.21016，卡的平方)。在近端曲小管內(nèi)，大部分C...

急性腎損傷(Acute kidney injury, AKI)是一種起病急、進(jìn)展快、預(yù)后差的嚴(yán)重臨床急癥。**近的證據(jù)表明，AKI伴隨著***的代謝異常，包括脂質(zhì)代謝的改變。然而，脂質(zhì)在AKI中的具體變化及其作用和調(diào)控機(jī)制目前尚不清楚。***小編給大家?guī)碛?...

越來越多的證據(jù)表明**相關(guān)巨噬細(xì)胞（TAMs）和外泌體在轉(zhuǎn)移前niche（生態(tài)位）形成中發(fā)揮重要作用。TAMs是轉(zhuǎn)移前生態(tài)位形成和結(jié)直腸*肝轉(zhuǎn)移(CRLM)的基礎(chǔ)。然而，**來源的外泌體miRNAs與TAMs相互作用的分子機(jī)制仍然很大程度上未知。本研究發(fā)現(xiàn)...

***是一種系統(tǒng)性疾病，與炎癥細(xì)胞浸潤和免疫相關(guān)途徑的***有關(guān)。本文旨在揭示與免疫相關(guān)的變化，并探索頸***斑塊形成過程中的新型免疫學(xué)特征。首先，我們應(yīng)用了集成的生物信息學(xué)方法，包括CIBERSORT和基因集富集分析（GSEA）?；虮磉_(dá)矩陣GSE28829...

4）USP35過表達(dá)減少erastin/RSL3觸發(fā)的鐵紊亂和鐵死亡 erastin和RLS3誘導(dǎo)的ROS和MDA生成因USP35過表達(dá)而減少(圖4A，B)。此外，在erastin和RLS3處理的*細(xì)胞中，HETEs水平升高，但在除12-HETE外的...

在Jurkat和小鼠T細(xì)胞中檢測到多個(gè)肽上特異性磷酸化位點(diǎn)的***缺失，包括典型的CDK4/6靶標(biāo)RB和RBL 1/2 (Fig. 3D-F)。值得注意的是，RB在兩種細(xì)胞蛋白組學(xué)中重疊，并且是全基因組CRISPR/Cas9篩選*****的（Fig. 3B，3...

AP損傷后胰腺巨噬細(xì)胞的表型變化 A動物模型使用雨蛙素誘導(dǎo)，。為了研究AP后的修復(fù)/再生過程，用更高劑量的雨蛙素（100μg/kg，每小時(shí)10次）誘導(dǎo)AP，并在一周內(nèi)的不同時(shí)間點(diǎn)收集胰腺。接受雨蛙素誘導(dǎo)***的AP小鼠在24小時(shí)后顯示出腺泡壞死和白細(xì)...

Circ-0004872(本研究稱為““circMAPK1”)來自MAPK1基因的第2-4個(gè)外顯子，形成一個(gè)490 nt的重疊環(huán)狀轉(zhuǎn)錄本(圖1e)。Sanger測序證實(shí)了擴(kuò)增的circMAPK1的頭尾剪接(圖1f)。接下來，我們研究了circMAPK1在GC細(xì)...

總之，如Fig. 9，CRC來源的外泌體miR-934可通過下調(diào)PTEN表達(dá)和***PI3K/AKT信號通路誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化。此外，外泌體miR-934極化的M2巨噬細(xì)胞可以通過CXCL13/CXCR5/NFκB/p65/miR934正反饋環(huán)促進(jìn)CRLM。...

作者收集并分析了黑色素瘤患者在***過程中的連續(xù)血液樣本，在此期間，患者接受CDK4/6i聯(lián)合靶向MEK抑制劑***，隨后接受PD-1和CTLA-4 ICB聯(lián)合***（Fig.6 F），患者達(dá)到完全緩解。使用CITE-seq技術(shù)評估一系列患者樣本，觀察到C...

4）APP/PS1小鼠大腦皮質(zhì)區(qū)受損星形膠質(zhì)細(xì)胞中氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的脂質(zhì)過氧化水平升高 我們研究了NOX4來源的氧化應(yīng)激在APP/PS1小鼠受損星形膠質(zhì)細(xì)胞中的作用。我們用免疫熒光染色法測定了APP/PS1小鼠和野生型(WT)小鼠大腦皮層GFAP陽性星形...

2、白樺素下調(diào)SREBP靶基因，降低細(xì)胞脂質(zhì)水平 由于SREBP-2是其自身的直接靶標(biāo)，因此白樺素將其表達(dá)下調(diào)40％（圖3A）。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉(zhuǎn)錄因子這一觀點(diǎn)一致，膽固醇合成途徑中的10個(gè)被測基因，例如HMGCR，HMG-Co...

5）下調(diào)STK39可抑制乳腺*細(xì)胞EMT、遷移和侵襲為了進(jìn)一步研究STK39在乳腺*中的作用，我們在MDA-MB-231和MDA-MB-157細(xì)胞中建立了STK39敲低的克隆。我們使用兩個(gè)**的shRNA實(shí)現(xiàn)了內(nèi)源性STK3980-90%的敲除效率。在這兩個(gè)克...

2.TYRO3使**細(xì)胞對抗PD-1***耐藥 在同系BALB/c小鼠模型中比較了Tyro3過表達(dá)(Tyro3-OE)和4T1-P細(xì)胞對抗mPD-1***的反應(yīng)。在荷4T1-P**的小鼠中，抗mPD-1******減少**的生長，并延長了生存期。這些...

為了確定s-flow和d-flow在體內(nèi)單細(xì)胞分辨率下對ECs基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)和染色質(zhì)可及性譜的全基因組影響，我們使用小鼠PCL模型進(jìn)行了scRNA-seq和scATAC-seq。將C57BL/6小鼠部分結(jié)扎，以暴露于血流的對側(cè)RCA作為對照，在LCA中誘導(dǎo)d...

盡管轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在過去幾十年中發(fā)展迅速，但由于芯片和RNA-seq之間固有的可變性差異，對混合數(shù)據(jù)的綜合分析仍然具有挑戰(zhàn)性。本文提出了Rank-In（/rank-in/）來糾正兩種技術(shù)之間的非生物效應(yīng)，從而能夠自由混合數(shù)據(jù)以進(jìn)行整合分析。網(wǎng)站首頁如...

二、染色質(zhì)的可及性明確了細(xì)胞的類型 我們使用R包Signac來研究不同細(xì)胞類型間染色質(zhì)可及性的差異。細(xì)胞類型可以根據(jù)差異開放區(qū)域（DARs）是開放的還是封閉的來區(qū)分(Fig.2a）。約20%(平均比例=0.2030.04)的DAR與各自細(xì)胞類型中的差...

4）USP35過表達(dá)減少erastin/RSL3觸發(fā)的鐵紊亂和鐵死亡 erastin和RLS3誘導(dǎo)的ROS和MDA生成因USP35過表達(dá)而減少(圖4A，B)。此外，在erastin和RLS3處理的*細(xì)胞中，HETEs水平升高，但在除12-HETE外的...

接下來為了證明，SUMOylation對BCas誘導(dǎo)的淋巴內(nèi)皮管的形成和遷移作用，通過其特異性抑制劑阻斷SUMOylation （2D-08）明顯抑制了該誘導(dǎo)過程（Figure 1 G-I）。以上數(shù)據(jù)表明，UBC9異常高表達(dá)與膀胱*進(jìn)展和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移正相關(guān)，...

長鏈非編碼RNAlongnoncodingRNA,IncRNA)指的是長度在200-100000nt之間的RNA分子。它們不編碼蛋白,但參與細(xì)胞內(nèi)多種過程調(diào)控。近年來的研究表明,IncRNA參與了X染色體沉默?；蚪M印記以及染色質(zhì)修飾,轉(zhuǎn)錄***。轉(zhuǎn)錄干擾。核...

腸道菌群與結(jié)直腸*(CRC)之間的關(guān)聯(lián)已被***研究。然而，用于多個(gè)人群的早期診斷標(biāo)記仍然難以捉摸。本研究對1056例糞便樣本進(jìn)行了綜合分析，以確定與CRC相關(guān)的微生物作為早期檢測CRC的標(biāo)志物。 1.meta-analysis 對來自4項(xiàng)研究...

4、Sirt1是在MRL/lpr小鼠中hUC-MSCs介導(dǎo)的CD4+T細(xì)胞衰老所必須的 接下來，檢測了Sirt1是否是hUC-MSCs促進(jìn)MRL/lpr脾CD4+T細(xì)胞衰老所足夠和必要的。研究發(fā)現(xiàn)，使用Sirt1抑制劑-EX527預(yù)處理MRL/lpr...

核仁小RNA(snoRNAs)是一類***存在于真核生物細(xì)胞核仁的小分子非編碼RNA，長度60-300nt，能與核仁核糖**白結(jié)合形成snoRNPs復(fù)合物[1]。在脊椎動物中編碼核仁小RNA的基因主要存在于蛋白編碼基因或非蛋白編碼基因的內(nèi)含子區(qū)域，并且經(jīng)過進(jìn)一...

NRF2是阻斷鐵死亡的關(guān)鍵介質(zhì)，TYRO3過表達(dá)的293T細(xì)胞中NRF2轉(zhuǎn)錄活性增加。TAM激酶下游的PI3K/AKT信號通路可增加NRF2轉(zhuǎn)錄活性，TYRO3-OE介導(dǎo)的NRF2轉(zhuǎn)錄***被AKT抑制劑MK2206消除。這些結(jié)果表明TYRO3通過AKT/NR...

神經(jīng)性疼痛和炎癥PCR基因芯片可用于研究與疼痛反應(yīng)的傳導(dǎo)、維護(hù)和調(diào)節(jié)相關(guān)的84個(gè)基因的表達(dá)。有害環(huán)境刺激、組織損傷和疾病都可以引起疼痛。由于疼痛折磨著大約20%的人口,所以疼痛既提供了大量的***目標(biāo)，同時(shí)也提供一個(gè)可以了解神經(jīng)系統(tǒng)的功能及分子機(jī)制的途徑。雖然...

在FENDRR/PITX2陽性對照組中也有類似的發(fā)現(xiàn)（Figure5G,H）。FRET技術(shù)分析顯示,與ELNAT1/UBC9TTS1組相比，熒光強(qiáng)度發(fā)生了巨大的變化：從520nm到570–580nm,熒光強(qiáng)度控制單鏈RNA/UBC9ssRNA/UBC9TT...

7.胰腺*組織中FBW7與NR4A1、SCD1相關(guān)作者檢測了在PADC患者組織中FBW7、NR4A1和SCD1表達(dá)之間的關(guān)系。對FBW7、NR4A1、SCD1進(jìn)行組織免疫熒光檢測，分別標(biāo)記不同的熒光信號。結(jié)果顯示，F(xiàn)BW7低表達(dá)時(shí)，NR4A1和SCD1高表...

由于MLL1在HoxBlinc過表達(dá)介導(dǎo)的異常造血過程中至關(guān)重要，HSPC中HoxBlinc過表達(dá)可能通過增加MLL1募集來***其靶基因，從而提高H3K4me3占用率，以促進(jìn)增強(qiáng)子/啟動子染色質(zhì)的可及性。為了證實(shí)這一點(diǎn)，使用WT和HoxBlincTg L...

因?yàn)镃XCL13是一種趨化劑，可以促進(jìn)表達(dá)CXCR5的細(xì)胞趨化，使用IHC染色評估其在CRC中的表達(dá)，結(jié)果顯示CXCR-5在結(jié)直腸*組織中的染色強(qiáng)于正常組織，說明M2極化巨噬細(xì)胞分泌的CXCL13主要作用于CRC細(xì)胞（Fig. 7d）。PMA預(yù)處理后的THP-...

生物發(fā)光成像結(jié)果顯示，在circACTN4過表達(dá)組中檢測到更強(qiáng)和更多的生物發(fā)光信號，而circACTN4沉默組中的小鼠與對照組相比顯示出更少的生物發(fā)光轉(zhuǎn)移數(shù)量。與對照組相比，circACTN4 過表達(dá)組的小鼠總體存活率較低，肝轉(zhuǎn)移范圍更廣。***，我們通過 I...