4)M1-BMDMs來源的外泌體在體內(nèi)阻礙脊髓損傷后的運動功能恢復(fù)和破壞BSCB 為了進一步研究巨噬細胞在SCI微環(huán)境中的作用及其對血管內(nèi)皮細胞的潛在影響,我們提取并鑒定了來自M1-BMDMs(M1-Exos)的外泌體。脊髓損傷后立即注射外泌體,在指...
六、多組學(xué)方法分析表征近端小管細胞子集 Cicero研究了從PT到PT_VCAM1轉(zhuǎn)變過程中染色質(zhì)可及性的變化。VCAM1和TPM1轉(zhuǎn)錄增加(圖6a)與VCAM1基因體和啟動子區(qū)域染色質(zhì)可及性增加相關(guān)(圖6b,c)。同樣,SLC5A12和SLC4A4...
QKI促進NSCLC細胞中circNDUFB2的生物發(fā)生 circNDUFB2和NDUFB2均來自NDUFB2 pre-mRNA,而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調(diào)。因此,推測circNDUFB2的下調(diào)在轉(zhuǎn)錄后發(fā)生。我們在circNDUF...
另外,相對于對照組,在生理條件下,單獨使用siFth不能顯著增加ROS的產(chǎn)生。對鐵死亡的抗性與抑制BODIRY-C11氧化有關(guān)。與上述ROS結(jié)果一致。測量了鐵死亡的幾種推定生物標志物,包括xCT,Cox2和4HNE表達。如預(yù)期的那樣,與對照組+刮擦損傷組相比,...
結(jié)果1)AKI伴有明顯的脂質(zhì)積累,并與腎損傷的嚴重程度高度正相關(guān) 根據(jù)脂質(zhì)代謝組學(xué)分析結(jié)果,我們發(fā)現(xiàn)AKI組織中各類甘油三酯(TGs)含量***增加(圖1A)??紤]到AKI中的脂質(zhì)積累,我們進行實驗來確定其臨床意義。我們對不同嚴重程度的AKI動物標本...
1)LINC00926被篩選為PGK1負調(diào)控的lncRNA,與乳腺*臨床結(jié)果相關(guān) 為了探索負調(diào)控PGK1的lncRNAs,我們根據(jù)圖1A所示的篩選策略對乳腺*的三個數(shù)據(jù)庫進行了分析。我們鑒定了3個lncRNA,LINC00926,LINC01089和...
一、YTHDF1在胃*中的過表達 通過評估YTHDF1突變的分布,我們發(fā)現(xiàn)65%的突變是基因擴增,這通常會導(dǎo)致基因產(chǎn)物的過表達(圖1A).通過對TCGA數(shù)據(jù)集進行分析,發(fā)現(xiàn)YTHDF1在胃*患者中的表達確實明顯高于正常組織(圖1B)。YTHDF1的高...
**近有報道稱,ALS/FTD中TDP-43的聚集可以隔離核孔蛋白、轉(zhuǎn)運蛋白和其他因子,表明TDP-43的聚集強烈破壞核質(zhì)轉(zhuǎn)運(NCT)和核孔復(fù)合體。此外,在AD、ALS和亨廷頓氏病(HD)中NCT也被破壞,提示在這些神經(jīng)退行性疾病中有一個共同的功能失調(diào)途徑。...
二、胎兒造血過程中分化軌跡的推斷 接下來,研究者使用力導(dǎo)向圖繪制算法推斷了人類胚胎發(fā)育期間造血細胞的分化軌跡。結(jié)果顯示HSCs/MPPs位于軌跡頂端,并且在HSCs/MPPs下游,研究者鑒定了三個高度增殖的寡能祖細胞群,即MEMPs(紅系細胞、MKs...
在沒有RNA配體的情況下,RIG-I采用一種自動抑制的構(gòu)象,CARDs發(fā)出信號。因此假設(shè)circNDUFB2可能通過促進其CARDs釋放***RIG-I。用Co-IP檢測RIG-I的CARDs(FLAG-CARD)和螺旋酶結(jié)構(gòu)域(HA-ΔCARD)之間的相互作...
ESCRT-III復(fù)合物在ferroptosis期間被***,并拮抗細胞死亡在 壞死和焦亡過程中,依賴于ESCRT-III復(fù)合物作用的膜修復(fù)可以延緩細胞死亡。作者使用CHMP4B斑點形成作為代替ESCRT-III***。**初,CHMP4B主要表現(xiàn)為...
三、染色質(zhì)可及性與細胞類型特異性轉(zhuǎn)錄因子活性和染色質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)有關(guān) HNF4A編碼驅(qū)動近端小管分化的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。chromVAR檢測到近端小管DAR中HNF4A結(jié)合基序的富集(圖3b,基序活性),這是HNF4A中染色質(zhì)可及性增強(圖3b,基因活性...
L-14c-胱氨酸攝取試驗結(jié)果顯示,YTHDC2通過其YTH域抑制了H1299細胞產(chǎn)生的異種移植物、小鼠形成的LUAD和患者來源的LUAD細胞的胱氨酸攝取(圖3D-F)。圖3H證明了系統(tǒng)Xc功能受損與GSH水平降低相關(guān)。NAC和GSH給藥后發(fā)現(xiàn),KPYWT小鼠...
造血干細胞早期命運決定的機制在很大程度上尚不清楚。據(jù)推測,譜系特異性轉(zhuǎn)錄因子(TFs)在噪聲閾值以上的隨機表達可以鎖定一個細胞進入一個獨特的細胞命運。與此相一致的是,在多能造血細胞中觀察到與拮抗譜系相關(guān)的基因的共表達,包括關(guān)鍵的TFs,這表明在多能細胞室中存在...
如圖5所示,E8中的d-flow改變了白細胞流量和炎癥標志物(Il1β、Il6、Ccl2和Ccl3);ECM調(diào)節(jié)(Adamts4, Lamb1, Timp3,和Timp4);血管調(diào)節(jié)(Nos3, Ptgs2,和Edn1);和脂質(zhì)代謝(Tm6sf2、Lsr和...
褪黑素不能挽救Fth 敲低HT-22細胞中機械性損傷引起的鐵死亡 為了進一步證實褪黑素對Tth小鼠在Fth- KO小鼠中的上述作用,將HT-22細胞系用siRNA轉(zhuǎn)染,然后在體外進行機械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質(zhì)水平。鑒于脂...
同時,CD8T細胞和M0巨噬細胞顯示出**強的競爭作用。對免疫浸潤細胞進行PCA分析,結(jié)果表明,免疫浸潤可以區(qū)分晚期斑塊和早期斑塊。4.GSEA分析將所有表達數(shù)據(jù)分為早期和晚期斑塊組,然后進行GSEA分析。結(jié)果顯示與免疫細胞和免疫相關(guān)功能高度相關(guān)5.差異表達分...
人PTC組織中tRFs和tiRNAs的表達 為了鑒定人PTC組織中的tRFs和tiRNAs,收集3對PTC*組織和*旁組間,用于高通量測序,其結(jié)果比對至tRNAlibraryGtRNAdb文庫,并從中去除線粒體tRNA。**終累計獲得1723個tRN...
7、CFL1/PLD1軸介導(dǎo)低氧誘導(dǎo)的HCC細胞中AKT途徑的***之前的一項研究表明,PLD1***AKT及其下游mTOR通路促進HCC細胞增殖、侵襲。與此一致,作者觀察到CFL1敲除降低了p-AKT水平,在HCCLM3細胞中通過PLD1恢復(fù)增強了p-A...
乳腺*細胞外泌體增加TPH-1細胞中miR-138-5p的表達但抑制KDM6B的表達,但這種作用被miR-138-5p抑制劑處理廢除(圖3F-G)。轉(zhuǎn)染miR-138-5pmimic的乳腺*細胞增加了外泌體miR-138-5p的水平(圖3H)。過表達miR...
4)體外實驗表明,上調(diào)UCP1以減輕AKI期間的脂質(zhì)積累,可通過影響炎癥和凋亡,***抑制疾病進展 越來越多的證據(jù)表明,在AKI中有明顯的脂質(zhì)積累和UCP1的異常表達,并與腎損傷的嚴重程度有很強的相關(guān)性。為了確定脂質(zhì)積累是否影響AKI期間的細胞功能,...
1)NOX4水平在阿爾茨海默病患者皮質(zhì)區(qū)受損星形膠質(zhì)細胞中升高 為了探討NOX4在AD患者星形膠質(zhì)細胞損傷中的作用,我們分析了AD患者大腦皮質(zhì)星形膠質(zhì)細胞中NOX4蛋白水平是否升高。我們采用免疫熒光染色法檢測AD患者或非AD供者(正常)顳葉皮質(zhì)組織G...
質(zhì)膜塑造并保護真核細胞免受周圍環(huán)境的影響,對細胞生命至關(guān)重要。盡管重新密封受損膜的初始修復(fù)機制已經(jīng)很好地建立,但關(guān)于細胞如何在重建受損膜后恢復(fù)體內(nèi)平衡知之甚少。今年7月發(fā)表于《SCIENCE ADVANCES》的一篇研究表明,細胞通過***與巨胞飲作用相關(guān)的蛋...
5、hUC-MSCs調(diào)節(jié)MRL/lpr小鼠脾CD4+T細胞Sirt1/p53信號通過miR-199a-5p 文獻報道在**和自身免疫疾病中,hUC-MSCs能夠?qū)iRNAs轉(zhuǎn)移到周圍的細胞。因此,作者考慮miRNAs是否可能參與hUC-MSCs介導(dǎo)...
我們研究了FOXO3A是否通過LINC00926調(diào)節(jié)這些效應(yīng)。細胞增殖和集落形成分析顯示FOXO3A過表達***了乳腺*細胞的生長,而LINC00926敲低則促進了細胞的生長(圖6A和6B)。重要的是,下調(diào)LINC00926***減弱了FOXO3A調(diào)控細胞增殖...
GSEA和GO分析顯示,HOXBLINC的缺失會影響NPM1突變、HOXA9通路、**、細胞周期、細胞命運、髓樣細胞分化以及Wnt和JAK-STAT信號通路中涉及AML的通路和基因(圖1e-f)。此外,與對照組相比,HOXBLINC KD***抑制OCI-AM...
ESCRT-III復(fù)合物在ferroptosis期間被***,并拮抗細胞死亡在 壞死和焦亡過程中,依賴于ESCRT-III復(fù)合物作用的膜修復(fù)可以延緩細胞死亡。作者使用CHMP4B斑點形成作為代替ESCRT-III***。**初,CHMP4B主要表現(xiàn)為...
單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué) (scRNA-Seq) 模塊 scRNA-seq 模塊系統(tǒng)地組織了基因表達隨年齡增長的組織和細胞類型特異性異質(zhì)變化。該模塊提供不同細胞類型或亞型的高分辨率、綜合參考圖,以及它們的時空分布信息,以及在不同衰老相關(guān)或疾病條件下每種細胞類型...
三、原始表型和染色質(zhì)可及性 雖然基因表達反映了細胞身份的活躍狀態(tài),但順式調(diào)節(jié)元件(cre),包括啟動子和增強子,是決定細胞命運的潛在因素。因此,我們研究了npm1突變的AML樣本是否也會根據(jù)其順式調(diào)控景觀分層為原始和committed的集群。使用轉(zhuǎn)座...
2021年4月,加拿大UniversityAve和中國香港大學(xué)團隊與**研究所表觀遺傳學(xué)和基因組穩(wěn)定性小組在CellDeath&Differentiation雜志上發(fā)表了文章“ThePTENandATMaxiscontrolstheG1/Scell...