ROS及其細(xì)胞副產(chǎn)物是酪氨酸磷酸酶的有效抑制劑，、用抗霉素A培養(yǎng)T細(xì)胞可導(dǎo)致酪氨酸磷酸化的持續(xù)和升高(圖6a)，這被魚藤酮或NAC阻斷(圖6a,b)。免疫印跡分析顯示，在aa誘導(dǎo)的ROS下，酪氨酸磷酸化的***數(shù)量增加，但幾種不同的蛋白在NAC處理下有差異的磷酸化(圖6b)。TCR-reporter Nur77-GFP小鼠研究表明在TCR信號(hào)缺失的情況下，抗霉素A誘導(dǎo)GFP表達(dá);在低于連續(xù)刺激條件下誘導(dǎo)的信號(hào)時(shí)，抗霉素A處理產(chǎn)生的GFP與酪氨酸磷酸酶抑制劑orthovandate (50 μm)培養(yǎng)的T細(xì)胞表型相匹配(圖6c)。磷酸酪氨酸級(jí)聯(lián)促進(jìn)NFAT1的核積累，單獨(dú)的ROS誘導(dǎo)(通過抗霉素...

***我們來講一篇刊登在Nucleic Acids Research題名為MarkerDB: an online database of molecular biomarkers的文章。MarkerDB是一個(gè)整合已知臨床和選定的臨床前分子生物標(biāo)志物的數(shù)據(jù)庫，包括四種主要類型的分子生物標(biāo)記（化學(xué)，蛋白質(zhì)，DNA [遺傳]和核型）和四種生物標(biāo)記類別（診斷，預(yù)測(cè)，預(yù)后和暴露）。MarkerDB提供的信息包括：生物標(biāo)志物名稱和同義詞，相關(guān)條件或病理，詳細(xì)的疾病描述，詳細(xì)的生物標(biāo)志物描述，生物標(biāo)志物特異性，敏感性和ROC曲線，標(biāo)準(zhǔn)參考值（對(duì)于蛋白質(zhì)和化學(xué)標(biāo)志物），變體（對(duì)于SNP或遺傳標(biāo)志物） ），序列...

RIG-I對(duì)circNDUFB2誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)至關(guān)重要 RIG-I樣受體（RLR）家族可識(shí)別病毒RNA 會(huì)通過產(chǎn)生IFN和促炎性細(xì)胞因子來觸發(fā)針對(duì)病毒***的先天免疫反應(yīng)。已經(jīng)報(bào)道外源circRNA有效刺激由RIG-1介導(dǎo)的免疫信號(hào)傳導(dǎo)。從qRT-PCR分析獲得的數(shù)據(jù)表明，RIG-1敲低消除了circNDUFB2過表達(dá)誘導(dǎo)的免疫反應(yīng)，RIG-1被circNDUFB2上調(diào)。為了研究circNDUFB2和RIG-I之間的關(guān)聯(lián)，進(jìn)行RIP分析和RNA FISH免疫熒光實(shí)驗(yàn)。 結(jié)果表明circNDUFB2與RIG-1結(jié)合，并且它們共定位在細(xì)胞質(zhì)中。 circNDUFB2過表達(dá)后， circN...

1）USP35敲除抑制肺*細(xì)胞生長(zhǎng)、集落形成和**進(jìn)展 我們首先檢測(cè)了肺*組織和細(xì)胞系中USP35豐度的變化。如圖1A所示，USP35在肺ADC和SCC**中都***上調(diào)。與正常的BEAS2B和HBE肺上皮細(xì)胞系相比，USP35mRNA水平在肺*細(xì)胞系(A549、H358、H460、H1299和H1650)中也高度表達(dá)(圖1B)。鑒于H460和H1299細(xì)胞中USP35mRNA的豐度較高，我們?cè)谙乱豁?xiàng)研究中使用了這兩種細(xì)胞系。與mRNA水平一致，在H460和H1299細(xì)胞中USP35蛋白也增加了(圖1C)。為了闡明USP35在肺*發(fā)病機(jī)制中的作用，我們?cè)贖460和H1299細(xì)胞中沉默...

抑制MIR210HG和miR-337-3p/137過表達(dá)抑制**生長(zhǎng)測(cè)定了MIR210HG和miR-337-3p/137在體內(nèi)**模型中的功能。裸鼠實(shí)驗(yàn)，每組小鼠3只。結(jié)果與對(duì)照組相比，轉(zhuǎn)染sh-MIR210HG并過表達(dá)miR-337-3p和miR-137降低了**體積(圖8A)。轉(zhuǎn)染shMIR210HG并同時(shí)過表達(dá)miR-337-3p和miR-137的組**體積**小。免疫組化分析，與單獨(dú)轉(zhuǎn)染agomir-337-3p/137和sh-MIR210HG組相比，共轉(zhuǎn)染組HMGA2和Ki-67的表達(dá)較低(圖8B)。抑制MIR210HG和miR-337-3p/137過表達(dá)抑制**生長(zhǎng)我們測(cè)定了M...

6、白樺素降低***的發(fā)展 用LDLR敲除小鼠探索了白樺素對(duì)***病變形成的作用。LDLR缺陷小鼠用WD飲食并分別添加了成分，對(duì)照（鹽），洛伐他?。?0mg/kg/day）或白樺素（30mg/kg/day）處理14周。不同組的小鼠顯示出相似的食物攝入量和體重（圖7A-7B）。在經(jīng)白樺素處理的小鼠肝臟中，SREBP-1c和SREBP-2降低，脂質(zhì)合成基因（包括HMGCS，HMGCR和FAS）下調(diào)（圖7C）。但是，洛伐他汀可上調(diào)HMGCR和FAS基因的表達(dá)（圖7C）。白樺素極顯著降低了血液中的TC，TG和LDL-c的含量，并增加了HDL-c。洛伐他汀具有類似的作用，只是它不降低TG（圖7...

蛋白降解靶向嵌合體(Proteolysis-TargetingChimeras,PROTACs)是一種新的具有良好前景的藥物類型，其結(jié)構(gòu)類似于啞鈴，通過一個(gè)連接子(linker)連接“靶蛋白的配體”以及“E3泛素連接酶的招募配體”，即泛素-蛋白酶體系統(tǒng)選擇性降解靶蛋白。已成為一種新型***技術(shù)，具有優(yōu)于傳統(tǒng)抑制策略的潛在優(yōu)勢(shì)。***講一篇浙江大學(xué)侯廷軍教授團(tuán)隊(duì)發(fā)表在NucleicAcidsResearch期刊上的關(guān)于PROTAC在線數(shù)據(jù)庫的文章，文章提名為PROTAC-DB:anonlinedatabaseofPROTACs。PROTAC這項(xiàng)技術(shù)仍日趨成熟，但PROTAC的設(shè)計(jì)仍然是一個(gè)巨大的...

隨后，作者研究了YTHDC2是否通過SLC7A11抑制胱氨酸攝取。當(dāng)YTHDC2在H1299細(xì)胞中過表達(dá)時(shí)，并過表達(dá)SLC7A11完全恢復(fù)了受損的胱氨酸攝取(圖4E-G)。ATF4是SLC7A11轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子，ATF4在H1299細(xì)胞中上調(diào)SLC7A11(圖4H、I)。過表達(dá)YTHDC2仍然拮抗ATF4的作用(圖4H-J)。因此，YTHDC2損害依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取。結(jié)合臨床分析，YTHDC2表達(dá)下調(diào)，而SLC7A11表達(dá)上調(diào)(圖4K、L)，并且它們?cè)?*中呈負(fù)相關(guān)(圖4M)。 5.YTHDC2以m6A依賴的方式使SLC7A11mRNA不穩(wěn)定 作者為研究YTH...

公共比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫（CTD，/)是一個(gè)創(chuàng)新的數(shù)字生態(tài)系統(tǒng)，它將化學(xué)品、基因、表型、疾病和暴露的毒理學(xué)信息聯(lián)系起來，以促進(jìn)對(duì)人類健康的了解。整合了基于文獻(xiàn)、人工策劃的交互，以創(chuàng)建一個(gè)知識(shí)庫，協(xié)調(diào)跨物種異質(zhì)數(shù)據(jù)的化學(xué)暴露及其生物影響。在這兩年一次的更新中，報(bào)告CTD的含量增加了20%，現(xiàn)在提供了4500萬個(gè)毒性基因組關(guān)系，涉及600個(gè)比較物種的16300多種化學(xué)品、51300個(gè)基因、5500種表型、7200種疾病和163000次暴露事件。此外，通過CTD疾病頁面上的新數(shù)據(jù)選項(xiàng)卡（幫助填補(bǔ)環(huán)境健康方面的知識(shí)空白）和新的表型搜索參數(shù)（用于批量查詢和維恩分析工具），增加了化學(xué)表型內(nèi)容...

TransCirc數(shù)據(jù)庫整合了各種與翻譯相關(guān)的證據(jù)，檢索的結(jié)果能直觀的呈現(xiàn)翻譯產(chǎn)物的相關(guān)證據(jù)信息。數(shù)據(jù)共分析了328080種已知人類circRNA的翻譯潛能，有蛋白質(zhì)譜證據(jù)（MS）的circRNA有168個(gè)，核糖體印跡或多聚核糖體分析（RP/PP）的證據(jù)4284個(gè)circRNA，潛在翻譯產(chǎn)物序列分析（SeqComp）的301100個(gè)circRNA。有IRES預(yù)測(cè)結(jié)果的314138個(gè)circRNA，有m6A修飾位點(diǎn)信息的39397個(gè)circRNA，有翻譯起始位點(diǎn)信息（TIS）的9394個(gè)circRNA，有ORF信息的305016個(gè)circRNA。 促進(jìn)胰腺*的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。藥物保護(hù)科研國(guó)家...

PGE2增強(qiáng)IL4Rα信號(hào)以增強(qiáng)巨噬細(xì)胞的M2*** 巨噬細(xì)胞能夠響應(yīng)可變的局部微環(huán)境信號(hào)從一種功能表型切換到另一種功能表型。除了經(jīng)典的信號(hào)級(jí)聯(lián)（例如，IL4/IL4Rα），巨噬細(xì)胞還可以整合由細(xì)胞外刺激觸發(fā)的代謝線索，以***它們的M2表型。在這里，我們想知道PGE2是否也參與了AP損傷后胰腺巨噬細(xì)胞的M2極化。為此，我們首先檢查了AP損傷后PGE2的動(dòng)態(tài)表達(dá)。COX1和COX2是產(chǎn)生前列腺素的兩種關(guān)鍵酶。在這里我們發(fā)現(xiàn)Ptgs2(COX2)的表達(dá)在第3天達(dá)到峰值，而Ptgs1(COX1)的表達(dá)在第1天下降并在第3天回到基礎(chǔ)水平。一致地，免疫熒光分析顯示PGE2在第3天升高，并在第...

4、外泌體miR-138-5p通過抑制KDM6B表達(dá)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞極化 隨后，作者研究了在不同培養(yǎng)條件下TPH-1的表達(dá)譜。首先，和**細(xì)胞共培養(yǎng)抑制了M1相關(guān)基因的表達(dá)，IL-6，TNF-α，和IL-1β，但是增加了M2相關(guān)基因的表達(dá)CD163，Arg-1，IL-10,TGF-β和VEGFA。過表達(dá)KDM6B部分抑制了上述表現(xiàn)改變（圖4A-B）。流式檢測(cè)顯示乳腺*細(xì)胞和TPH-1的共培養(yǎng)增加了CD163陽性細(xì)胞數(shù)比例，但是過表達(dá)KDM6N可以抑制這種效果（圖6C）。類似的，過表達(dá)KDM6B抑制了miR-138-5p誘導(dǎo)的M2極化（圖4D-F）。與對(duì)照組相比，乳腺*來源的外泌體miR-...

利用METABRIC數(shù)據(jù)集，我們?cè)u(píng)估了1459例ER+乳腺*中17個(gè)常見Wnt/β-catenin通路基因的表達(dá)，包括幾個(gè)Wnt靶基因(圖7a)。為了確定INPP4B是否促進(jìn)PI3K和Wnt/β-catenin通路之間的對(duì)話，我們用增加劑量的PI3K抑制劑BKM120(0.5和1M)處理gfp載體和GFPINPP4BMCF-7細(xì)胞，并測(cè)量Wnt靶基因AXIN2、LEF1和MYCN的mRNA表達(dá)(圖7bd)。在gfp載體細(xì)胞中，低劑量的BKM120對(duì)Wnt靶基因表達(dá)的影響**小，而高劑量的Wnt基因表達(dá)降低。在GFP-INPP4B表達(dá)細(xì)胞中，低濃度的BKM120部分挽救了Wnt基因表達(dá)的增加，在...

接下來為了證明，SUMOylation對(duì)BCas誘導(dǎo)的淋巴內(nèi)皮管的形成和遷移作用，通過其特異性抑制劑阻斷SUMOylation （2D-08）明顯抑制了該誘導(dǎo)過程（Figure 1 G-I）。以上數(shù)據(jù)表明，UBC9異常高表達(dá)與膀胱*進(jìn)展和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移正相關(guān)，SUMOylation參與膀胱*的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。 2.EVs介導(dǎo)的ELNAT1過表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān) EVs介導(dǎo)的lncRNA轉(zhuǎn)運(yùn)是**細(xì)胞與TME之間通過信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)發(fā)生的一個(gè)關(guān)鍵過程。作者采集各5例的健康志愿者與BCas患者的尿液，通過NGS測(cè)序確定了EVs中l(wèi)ncRNA的整體表達(dá)譜，結(jié)合與SUMOylation途徑的相關(guān)性，*...

5）DRD2通過阻斷TAK1的磷酸化來限制NF-κB信號(hào)的*** NF-κB信號(hào)的***對(duì)于觸發(fā)炎癥小體組裝和隨后的焦亡是必不可少的。IF染色顯示DRD2幾乎阻斷了p-p65的核易位(圖5A)，但這種抑制被Mφ所抵消(圖5B)。核和細(xì)胞質(zhì)提取物也顯示DRD2抑制了p-p65的核易位(圖5C)。如WB結(jié)果所示，在LPS刺激下，DRD2抑制IKKα/β、IκBα和p65的磷酸化(圖5D)。異位DRD2表達(dá)也***抑制了Mφ誘導(dǎo)的p65磷酸化和IKKα/β的上游***(圖5E)。WB結(jié)果顯示DRD2下調(diào)NF-κB的下游靶點(diǎn)ICAM-1。然而，這種下調(diào)被Mφ所抵消(圖5E)。抑制IKKα/β...

由于腸道微生物群在多囊卵巢綜合征的起始和發(fā)展中起著重要作用，作者還研究DHEA和tempol是否影響腸道的氧化還原狀態(tài)。腸道MDA、3-NT和AGEs水平在PCOS大鼠中***高于對(duì)照組和氧化生物標(biāo)記的增加被tempol處理消除(圖3K-M)。此外，tempol***增加PCOS大鼠的腸道SOD1和SOD2表達(dá)(圖3N)。因此，這些結(jié)果表明tempol能夠降低PCOS大鼠的腸道氧化應(yīng)激。 4. Tempol減輕PCOS大鼠腸道微生物失調(diào) 隨后，通過rarefaction和Shannon曲線(Fig. 4A-B)，以及4個(gè)α-多樣性指數(shù)(ACE)、Shannon、Simpson和...

確實(shí)，MMTVneu**的caspase-3陽性細(xì)胞比相應(yīng)的Pten+/+少;綜上所述，這些結(jié)果表明，PTEN不能被ATM磷酸化的細(xì)胞對(duì)基因毒性應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡具有抗性。為了評(píng)估表達(dá)PTEN-398A且DNA損傷未解決的細(xì)胞在輻照(圖2B, C和補(bǔ)充圖4B, C)后的持續(xù)存在是否是誘導(dǎo)凋亡反應(yīng)失敗的結(jié)果，我們?cè)贗R之前先用泛caspase抑制劑z-VAD-FMK (zVAD)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行預(yù)處理。與DMSO處理相比，zVAD增加了PTEN-WT細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量，其水平與DMSO處理的PTEN-398A細(xì)胞相當(dāng)(補(bǔ)充圖5F)。然而，需要注意的是，zVAD預(yù)處理也略微增加了IR后PT...

一、在pik3a突變的ER+乳腺*中，INPP4B的表達(dá)增加 INPP4B被確定為人類乳腺*er陽性標(biāo)記物.INPP4B在三陰性乳腺*中表達(dá)缺失，然而，它作為其他**中潛在的致*基因的出現(xiàn)，促使我們檢測(cè)其在ER+乳腺*中的相對(duì)表達(dá)和功能。INPP4B蛋白表達(dá)缺失與三陰性乳腺*相關(guān)(圖1a, b) 增加INPP4B蛋白表達(dá)在14 40%的乳腺*相對(duì)于正常組織與ER / PR-positivity和腔內(nèi)(ER +和/或PR+)乳腺*亞型(圖1 a, b和補(bǔ)充圖1 b, c)。在mRNA表達(dá)數(shù)據(jù)不能用于這些cohorts使用組織掃描乳腺*cDNA陣列I IV (OriGene)檢測(cè)130例...

表觀基因組學(xué)(ChIP-Seq)模塊 ChIP-seq模塊目前包含大量染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序(ChIP-seq)數(shù)據(jù)，反映了特定的衰老相關(guān)基因座是如何受組蛋白修飾和轉(zhuǎn)錄因子調(diào)節(jié)的。這些數(shù)據(jù)有助于闡明調(diào)控因素如何在全基因組范圍內(nèi)影響衰老過程中的基因表達(dá)。ChIP-seq數(shù)據(jù)來自已發(fā)表的與衰老相關(guān)的文章，并使用相同的分析方法處理原始數(shù)據(jù)以保持一致性。直觀地顯示了衰老過程中特定基因組位點(diǎn)不同轉(zhuǎn)錄因子的富集或組蛋白修飾的變化。 蛋白質(zhì)組學(xué)（蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用）模塊 衰老過程中蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)受損是典型的，蛋白質(zhì)相互作用隨著年齡的增長(zhǎng)而發(fā)生顯著變化。蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用模塊（PPI）旨...

6）Pex衍生的CD44v6和C1QBP的高表達(dá)預(yù)示著PDAC患者的肝轉(zhuǎn)移和低生存率采用免疫組化和westernblot檢測(cè)肝轉(zhuǎn)移灶周圍肝組織和正常肝組織的纖維化ECM微環(huán)境。與體內(nèi)實(shí)驗(yàn)一致，纖維連接蛋白、I型膠原和α-SMA水平***升高，而玻連蛋白和固生蛋白C水平下調(diào)(圖7A，B)。接下來，我們研究了外泌體衍生CD44v6和C1QBP在PDAC患者中的預(yù)后價(jià)值。外泌體CD44v6和C1QBP在PDAC組織中的表達(dá)明顯高于正常胰腺組織(圖7C)。此外，有肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達(dá)明顯高于無肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者(圖7C)。免疫電鏡顯示，CD44v6和C1QBP在P...

六、急性GvHD的嚴(yán)重程度可以在造血干細(xì)胞移植前同時(shí)從所有三個(gè)身體部位的微生物群預(yù)測(cè) 在一個(gè)聯(lián)合模型中，來自所有三個(gè)身體部位的分類群都可以預(yù)測(cè)HSCT之前樣本的aGvHD嚴(yán)重程度(圖6)。該報(bào)道發(fā)現(xiàn)了7種預(yù)測(cè)性asv，其中2種來自腸道，1種來自口腔，1種來自鼻子，2種主要在口腔中發(fā)現(xiàn)，但也在鼻子中發(fā)現(xiàn)，1種主要在口腔中發(fā)現(xiàn)，但也在鼻子和腸道中發(fā)現(xiàn)(圖6A)。3個(gè)類群(副弧菌屬ASV_131、放線菌屬ASV_568和梭菌屬ASV_166)起源于后來發(fā)展為II級(jí)和IV級(jí)aGvHD的患者。一致地，這些asv的log-transformed相對(duì)豐度在檢查前、適應(yīng)開始和HSCT當(dāng)天，在aGvH...

2021年6月，***一篇發(fā)表在Curr Biol（IF=9.601）的文章（The RAS GTPase RIT1 compromises mitotic fidelity through spindle assembly checkpoint suppression.）從共生功能體視點(diǎn)的角度對(duì)29名接受同種異體造血干細(xì)胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進(jìn)行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了RIT1直接與SAC**組件MAD2和p31conmet相互作用；CDK1在有絲分裂過程中磷酸化RIT1并抑制其與SAC的相互作用；RIT1是細(xì)胞有絲分裂及時(shí)進(jìn)展所必需的；RIT1致病水平促進(jìn)染色體...

3）FTO是SsD的直接靶點(diǎn) 基于基因芯片數(shù)據(jù)，SsD介導(dǎo)的白血病發(fā)生抑制主要是由于m6A通路，我們假設(shè)SsD可能調(diào)節(jié)白血病m6ARNA甲基化。我們確定了FTO在白血病發(fā)生中起作用。為了驗(yàn)證SsD與FTO的直接結(jié)合，我們首先基于已發(fā)表的FTO晶體結(jié)構(gòu)進(jìn)行分子對(duì)接分析。SsD的比較好結(jié)合位點(diǎn)表現(xiàn)出與底物結(jié)合位點(diǎn)互補(bǔ)的特殊形狀，占據(jù)了整個(gè)結(jié)合口袋(圖3A-B)。4個(gè)氨基酸殘基(R96,K216,E234,R332)參與了與SsD的相互作用(圖3C)，在抑制FTO活性方面發(fā)揮了關(guān)鍵作用。在NB4和Kas-1AML細(xì)胞中，SsD與FTO蛋白的結(jié)合導(dǎo)致了明顯的熱轉(zhuǎn)移，表明對(duì)熱降解有保護(hù)作用(圖...

隸屬于隸屬于梭狀芽孢桿菌目丁酸生成菌在移植后早期的腸道中枯竭,而變形菌門和乳酸菌門(如腸球菌)豐度增加,可能由于缺乏丁酸時(shí)腸腔內(nèi)的氧氣水平增加和***素耐藥性所致。然而，到目前為止，HSCT患者的微生物群動(dòng)態(tài)主要在HSCT后的***個(gè)月進(jìn)行詳細(xì)監(jiān)測(cè)，而不是長(zhǎng)期監(jiān)測(cè)。因此，目前尚不清楚微生物群是否以及何時(shí)恢復(fù)到造血干細(xì)胞移植前類似微生物群落結(jié)構(gòu)。條件誘導(dǎo)的腸上皮通透性可促進(jìn)細(xì)菌易位和菌血癥，被認(rèn)為是急性移植物抗宿主病(aGvHD)發(fā)病機(jī)制的第一步。急性GvHD是同種異體造血干細(xì)胞移植的常見副作用，同種異體供體T細(xì)胞對(duì)宿主體內(nèi)健康組織(包括腸道上皮)表現(xiàn)出細(xì)胞毒性活性。根據(jù)受影響***的程度，急性...

比較SLE-1和SLE-2組的轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜，結(jié)果顯示，除ISGs外，mtDNA編碼的OXPHOS基因的表達(dá)差異比較大（Fig. 1c, d）?？傊琒LE患者純化T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析根據(jù)ISG表達(dá)水平將其分為兩組，表達(dá)高I型IFN標(biāo)記的患者顯示線粒體編碼基因和線粒體相關(guān)代謝途徑的表達(dá)減少，在CD8 + T細(xì)胞中更明顯。這表明SLE中與I型IFN相關(guān)的線粒體功能失調(diào)。 2、ISGs高表達(dá)患者CD8+T細(xì)胞線粒體異常 在研究I型IFN信號(hào)與線粒體異常之間的潛在聯(lián)系之前，應(yīng)用計(jì)算機(jī)模擬和體外相結(jié)合的方法，根據(jù)I型IFN信號(hào)的強(qiáng)弱程度對(duì)SLE患者進(jìn)行分層：高水平的ISGs(IFN-hig...

先兆子病PCR基因芯片可以同時(shí)檢測(cè)影響胎盤發(fā)育失調(diào)的84個(gè)關(guān)鍵基因的表達(dá)。先兆子癇，是一種危及生命的疾病,主要表現(xiàn)為懷孕期間的***,胎盤的分娩是現(xiàn)有的唯--的***方法。這種疾病發(fā)生在孕期小于32周被稱為早期,超過32周則被稱為遲發(fā)性。先兆子癇的原因現(xiàn)在不完全清楚。許多患者會(huì)出現(xiàn)胎盤植入的失敗,這一現(xiàn)象提示我們雖然病征出現(xiàn)很晚，但可能在更早期先兆子病就有了影響。-個(gè)潛在的分子機(jī)制涉及到滋養(yǎng)細(xì)胞早期胎盤發(fā)育的血管重塑缺陷。隨著病情的發(fā)展，胎盤缺氧,引起炎癥和氧化應(yīng)激。這些過程導(dǎo)致的免疫細(xì)胞(如Th1細(xì)胞,中性粒細(xì)胞和自然殺傷細(xì)胞)的浸潤(rùn)。類似的過程會(huì)導(dǎo)致胎兒言內(nèi)發(fā)育遲緩,或胎兒的生長(zhǎng)發(fā)育不足。...

6、MAO-A阻斷**免疫***-人類TAM和臨床數(shù)據(jù)相關(guān)性研究 為了探索MAO-A阻斷***的翻譯潛力，首先研究了MAO-A對(duì)人巨噬細(xì)胞極化的調(diào)控。分析體外培養(yǎng)的免疫刺激M1樣和免疫抑制M2樣人單核細(xì)胞源性巨噬細(xì)胞的基因表達(dá)特征。有趣的是，在所有檢測(cè)的免疫檢查點(diǎn)、免疫刺激和免疫抑制基因中，MAOA是M2樣單核來源巨噬細(xì)胞（MDMs）中表達(dá)水平比較高的基因（圖6a），提示MAO-A可能在促進(jìn)人巨噬細(xì)胞免疫抑制極化中發(fā)揮作用。MDM培養(yǎng)的時(shí)間過程分析證實(shí)了巨噬細(xì)胞分化過程中MAO-A基因和蛋白表達(dá)上調(diào)，并在IL-4/IL-13誘導(dǎo)的免疫抑制極化后進(jìn)一步上調(diào)（圖6b-d）。用苯乙肼阻斷M...

此外，核輸出基因Emb (Exportin)的mRNA水平在tbi后***增加(圖1M)，而與對(duì)照組相比，微管相關(guān)蛋白Futsch的mRNA水平?jīng)]有變化(圖1圖Supplement 1H)，這與蛋白質(zhì)組學(xué)分析一致。Western blotting進(jìn)一步證實(shí)了tbi依賴性的果蠅幼蟲腦內(nèi)Nup214蛋白水平的升高(圖1N和O)。Western blot分析了損傷后幼蟲(0、2、4和6小時(shí))和成蟲(0、2、4、24和72小時(shí))的時(shí)間過程，以評(píng)估Nup214蛋白的水平。在檢測(cè)的時(shí)間點(diǎn)上，不管是幼蟲還是成人的大腦中，Nup214蛋白的水平都是上調(diào)的(圖1P,Q,R,S)，這表明創(chuàng)傷可能會(huì)破壞Nup214...

磷酸甘油酸激酶1 (PGK1)是糖酵解途徑的重要組成部分，與多種**的發(fā)***展有關(guān)。然而，PGK1抑制劑在*細(xì)胞中的抑制機(jī)制和生理意義尚不清楚。因此，***給大家介紹于2021年4月發(fā)表于“Molecular Therapy”（IF=8.986）的文章“FOXO3A-induced LINC00926 suppresses breast tumor growth and metastasis through inhibition of PGK1-mediated Warburg effect”。在這里，我們鑒定了一個(gè)負(fù)調(diào)控PGK1表達(dá)的lncRNA LINC00926，并預(yù)測(cè)乳腺*良好的臨床...

四、scRNA-seq和scATAC-seq數(shù)據(jù)整合 目前尚無人類胚胎HSPCs的染色質(zhì)可及性圖譜，研究者基于基因體可及性繪制細(xì)胞圖譜來整合scRNA-seq和scATAC-seq數(shù)據(jù)。首先使用6種豐富的細(xì)胞類型對(duì)scRNA-seq實(shí)驗(yàn)中篩選出的CD34+ CD38- 細(xì)胞進(jìn)行分類，結(jié)果顯示scATAC-seq數(shù)據(jù)集中指定細(xì)胞類型的頻率與scRNA-seq數(shù)據(jù)中的頻率高度一致，這表明染色質(zhì)可及性和轉(zhuǎn)錄組具有相關(guān)性。然而，不同類型的細(xì)胞在整個(gè)軌跡上有相當(dāng)大的混合，如HSCs/MPPs-Cycle***分布在七個(gè)集群中，這表明在HSCs/MPP群體中存在***的染色質(zhì)啟動(dòng)，從而導(dǎo)致了異質(zhì)...